- D. Rodrigo (I) (1199)
- D. Martinho (I) Pais (1200-1225)
- D. Vicente Hispano (1226-1248)
- D. Rodrigo (II) Fernandes (1248-1267)
- D. Frei Vasco (I) (1267-1278)
- D. Frei João (I) Martins (1278-1301)
- D. Vasco (II) Martins de Alvelos (1302-1313), antes bispo de Lamego
- D. Rodrigo (III) (1313)
- D. Estêvão (I) (1314-1316)
- D. Martinho (II) (1319-1322)
- D. Guterre (1322-1326)
- D. Bartolomeu (1326-1345)
- D. Afonso (I) Dinis (1346-1347), depois bispo de Évora
- D. Lourenço Rodrigues (1349-1356), depois bispo de Coimbra e bispo de Lisboa
- D. Estêvão (II) Tristão (1357-1360?)
- D. Gil (I) Cabral (1360-1362)
- D. Vasco (III) de Menezes (1362-1367)
- D. Gonçalo (I) Martins (1367)
- D. Afonso (II) Correia (1367-1384) ou Afonso Domingues de Linhares (1364-1394)
- D. Frei Vasco (IV) de Lamego (1384-?)
- D. Afonso (III) Ferraz (?-1396)
- D. Gil (II) (1397)
- D. Gonçalo (II) Vasques da Cunha (1397-1426)
- D. Luís (I) da Guerra (1427-1458)
- D. Frei João (II) Manuel (1459-1476)
- D. João (III) Afonso Ferraz (1477-1478)
- D. Álvaro (I) de Chaves (1479-1481), primeira vez
- D. Garcia de Menezes (1481-1484), administrador apostólico
- D. Álvaro (I) de Chaves (1484-1496), segunda vez
- D. Pedro Vaz Gavião (1496-1516)
- Cardeal Infante D. Afonso (IV) de Portugal (1516-1519), depois bispo de Viseu e, em acumulação, bispo de Évora e arcebispo de Lisboa
- D. Miguel da Silva (1516-1519), administrador apostólico
- D. Jorge de Melo (1519-1548)
- D. Cristóvão de Castro (1550-1552)
- D. João (IV) de Portugal (1556-1585)
- D. Manuel (I) de Quadros (1585-1593)
- D. Nuno de Noronha (1593-1608), também bispo de Viseu
- D. Afonso (V) Furtado de Mendonça (1609-1616), também bispo de Coimbra-conde de Arganil, arcebispo de Braga, arcebispo de Lisboa e vice-rei de Portugal
- D. Francisco de Castro (1617-1630)
- D. Frei Lopo de Sequeira Pereira (1632-1636)
- D. Dinis de Melo e Castro(1639)
- D. Diogo Lobo (1640), eleito, não confirmado pelo Papa
- D. Pedro (II) de Lencastre, depois arcebispo de Évora e arcebispo de Braga, 5.° Duque de Aveiro, não confirmado pelo Papa
- D. Frei Álvaro (II) de São Boaventura (1669-1672)
- D. Martim Afonso de Melo (1672-1684)
- D. Frei Luís (II) da Silva (1685-1691)
- D. João (V) de Mascarenhas (1692-1693)
- D. Rodrigo (IV) de Moura Teles (1694-1704), também arcebispo de Braga
- D. António (I) de Saldanha (1705-1711)
- D. João (VI) de Mendonça (1713-1736)
- D. Frei José (I) Fialho, O. Cist. (1739-1741)
- D. Bernardo António de Melo Osório (1742-1774)
- D. Jerónimo Rogado do Carvalhal e Silva (1775-1797)
- D. José (II) António Pinto de Mendonça Arrais (1797-1822)
- D. Frei Carlos de São José de Azevedo e Moura (1824-1828)
- D. Joaquim José Pacheco de Sousa (1832-1857)
- D. Manuel (II) Martins Manso (1858-1878)
- D. Tomás Gomes de Almeida (1883-1903)
- D. Manuel (III) Vieira de Matos (1903-1914)
- D. José (III) Alves Mattoso (1914-1952)
- D. Domingos da Silva Gonçalves (1952-1960)
- D. Policarpo da Costa Vaz (1960-1979)
- D. António (II) dos Santos (1979-2005)
- D. Manuel (IV) da Rocha Felício (2005-presente)