O Rev.do Cónego José Miguel Barata Pereira nasceu em Lisboa a 7 de novembro de 1971.
Frequentou o Pré-Seminário de Lisboa e ingressou no Seminário de Almada, então pertencente ao Patriarcado de Lisboa, e depois no Seminário Maior de Cristo Rei dos Olivais, do Patriarcado de Lisboa. Frequentou a Faculdade de Teologia da Universidade Católica Portuguesa, em Lisboa, onde obteve a Licenciatura em Teologia, com uma tese intitulada “Ser Igreja, ser na Igreja – Do ser comunhão ao agir vocacional”.
Foi ordenado sacerdote a 29 de junho de 1996 para o clero do Patriarcado de Lisboa. Após a ordenação foi nomeado Prefeito do Seminário Menor de São José de Caparide, em Estoril (1996-1999).
Foi Vice-Reitor do Seminário Menor de Nossa Senhora da Graça, em Penafirme (1999-2007).
Durante o mesmo período, exerceu o ministério pastoral como colaborador nas Paróquias vizinhas de Nossa Senhora da Luz, em A-dos-Cunhados, e São Miguel, em Vimeiro, pertencentes à Vigararia de Torres Vedras, da qual foi Vigário Forâneo (2006-2007). Foi também Membro eleito do Conselho Presbiteral (1996-1999; 2000-2003; 2009-2012);Professor de Educação Moral Religiosa Católica no Externato de Penafirme (2001-2007); Assistente do Núcleo do Oeste do Corpo Nacional de Escutas (2006-2007); Vice-Reitor do Seminário Maior Cristo Rei dos Olivais (2007-2011); Diretor do Pré-Seminário (2009-2012); Diretor do Setor de Animação Vocacional (2007-2017).
Atualmente é Reitor do Seminário Maior Cristo Rei dos Olivais (desde 2011); Secretário do Secretariado de Ação Pastoral (desde 2007); Responsável pela formação dos Candidatos ao Diaconado Permanente (desde 2007); Membro nato do Conselho Presbiteral (desde 2012); Membro nato do Conselho Pastoral Diocesano (desde 2012); Membro do Capítulo dos Cónegos da Sé Patriarcal (desde 2017). É também Membro da Equipa Regional do Centro Nacional de Escutas; Assistente Espiritual de 2 Equipas “Cristo na Empresa”, da Associação Cristã de Empresários e Gestores (ACEGE), e Assistente Espiritual de 3 Equipas de Nossa Senhora (ENS).